Vào ngày 23 tháng 2 năm 2008, một chiếc B-2 đã bị rơi trên đường băng ngay sau khi cất cánh từ Căn cứ không quân Andersen ở Guam.[1] Chiếc B-2, biệt danh Spirit of Kansas, có số hiệu 89-0127 và thuộc biên chế Phi đoàn Ném bom số 393, Không đoàn Ném bom 509, đóng ở Căn cứ Không quân Whiteman, Missouri, và đã bay được 5.100 giờ bay,[5] là vụ tai nạn đầu tiên của một chiếc B‑2.[6]

Phi hành đoàn gồm hai sĩ quan (Thiếu tá Ryan Link và Đại úy Justin Grieve) đã cố gắng điều khiển chiếc máy bay ném bom nhưng họ đã không thể làm được, và khi một trong những đầu cánh của nó tiếp xúc với mặt đất, họ đã nhảy dù thoát ra và sống sót sau vụ tai nạn. Máy bay bị phá hủy hoàn toàn, tổng thiệt hại ước tính khoảng 1,4 tỷ USD.[7][8] Con số này tương đương với 1,58 tỷ đô la Mỹ vào năm 2018.

Theo Air Force Times, không có đạn dược nào trên máy bay.[4]Báo cáo về vụ tai nạn của Bộ Tư lệnh Không quân Mỹ nói rằng "vật liệu tuyệt mật" đã được chất lên máy bay ném bom vào buổi sáng mà chiếc máy bay đang trở về Căn cứ Không quân Whiteman "sau một đợt triển khai kéo dài 4 tháng để hỗ trợ sự hiện diện liên tục của Lực lượng Không quân Thái Bình Dương.[8]

Tại Bệnh viện Hải quân Guam, sau khi đánh giá thương tích, một phi công đã được xuất viện còn người thứ hai phải nhập viện. Một chiếc B-2 đang ở trên không đã được gọi trở lại Andersen sau vụ tai nạn, nơi nó và những chiếc B-2 khác nằm dưới đất cho đến khi cuộc điều tra ban đầu về vụ tai nạn hoàn tất. Sáu chiếc Boeing B‑52 của Phi đoàn Ném bom 96, Không đoàn Ném bom số 2 tại Căn cứ Không quân Barksdale, Louisiana, đã được triển khai để thay thế cho những chiếc B‑2 tại Andersen.[1][9]

Chỉ huy trưởng của Không đoàn Ném bom 509, Chuẩn tướng Garrett Harencak, sau sự việc trên đã tạm ngừng hoạt động bay đối với tất cả 20 chiếc B ‑ 2 còn lại để xem xét các thủ tục. Harencak gọi việc ngừng bay này là "tạm dừng an toàn" và tuyên bố rằng những chiếc B‑2 sẽ tiếp tục bay nếu được yêu cầu hoạt động ngay lập tức.[10] Đội bay B‑2 trở lại trạng thái bay vào ngày 15 tháng 4 năm 2008.[11]